Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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