Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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