Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms