Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Prdm16A2A935 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm16A2A935 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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