Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pramef6A2A8M8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms