Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms