Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Speer3W4VSP1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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