Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms