Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mbd3Q9Z2D8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mbd3Q9Z2D8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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