Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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