Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms