Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms