Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms