Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms