Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf4Q9QZS2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf4Q9QZS2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf4Q9QZS2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf4Q9QZS2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf4Q9QZS2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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