Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col4a3Q9QZS0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col4a3Q9QZS0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col4a3Q9QZS0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col4a3Q9QZS0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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