Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms