Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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