Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pole3Q9JKP7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pole3Q9JKP7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms