Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms