Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r56Q9EPS9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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