Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tlr1Q9EPQ1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tlr1Q9EPQ1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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