Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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