Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Med27Q9DB40 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Med27Q9DB40 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms