Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms