Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms