Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms