Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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