Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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