Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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