Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms