Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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