Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snw1Q9CSN1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms