Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ykt6Q9CQW1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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