Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms