Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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