Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd1Q99MV1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms