Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms