Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PtprtQ99M80 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PtprtQ99M80 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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PtprtQ99M80 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtprtQ99M80 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtprtQ99M80 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtprtQ99M80 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtprtQ99M80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PtprtQ99M80 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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