Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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