Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms