Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc8Q8VD72 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms