Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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