Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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