Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

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Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ncapd2Q8K2Z4 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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