Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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