Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Cldn34c1Q8K193 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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