Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nup88Q8CEC0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms