Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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