Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fbxo48Q8CAT8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fbxo48Q8CAT8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms